...infatti se la macchina viene rinominata dopo l'installazione di SQL, il spoftware di installazione non riesce a connettersi a SQL Server nel modo corretto.

Questo perche' esso guarda un record nelle tabelle di sistema del DB master che non viene aggiornato dall'operazione.

Per farlo manualmente bisogna lanciare
sp_dropserver 'vecchionome'
sp_addserver 'nuovonome', 'LOCAL'
ovviamente se e' l'instanza nominale bisogna inserirla nei nomi con la consueta sintassi: 'nomemacchina1nomeinstanza'.
Infine bisogna riavviare SQL Server.

Se invece viene rinominata la macchina server del CRM fare attenzione ad andare a togliere il vecchio account macchina dalle security di SQL Server prima di lanciare l'installazione del CRM.